一种鉴定蛋白质突变和翻译后修饰的算法

计算机工程与应用 ›› 2007, Vol. 43 ›› Issue (28): 61-64.

一种鉴定蛋白质突变和翻译后修饰的算法

谢靖宇,谢深泉

湘潭大学信息工程学院,湖南湘潭 411105

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2007-10-01 发布日期:2007-10-01
通讯作者: 谢靖宇

Algorithm identifying mutations and post-translational modification of protein

XIE Jing-yu,XIE Shen-quan

College of Information Engeering,Xiangtan University,Xiangtan,Hunan 411105,China

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2007-10-01 Published:2007-10-01
Contact: XIE Jing-yu

摘要/Abstract

摘要： 提出的MSA（Modified Spectral Alignment）算法,改进了SA（Spectral Alignment）算法中D（k）和k-最佳Spectral Alignment的求解方式,并在算法中引入“双端考虑”。实验结果数据表明,MSA算法有效地提高了鉴定含突变或翻译后修饰的蛋白质的能力。

关键词: 蛋白质, 翻译后修饰, 突变, MSA算法

Abstract: The algorithm MSA is presented in this paper,which improved the way to compute D（k） and k-optimal Spectral Alignment of SA algorithm and took into account simultaneous analysis of N-terminal and C-terminal ions.The experiment result data shows that efficiently improves the capability of identifying proteins containing mutations or post-translational modifications.

Key words: protein, Post-translational Modification, mutation, MSA algorithm

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